单个DNA分子的最高分辨率图像:显示了原子在“
科学家捕获了有史以来最高分辨率的单个DNA分子图像,显示了原子在如何“扭曲舞动”,这使人们能够绘制和观察DNA单链中每个原子的运动和位置。
许多人都知道,DNA的分子结构为双螺旋形,为什么会发生“扭曲”?这得从DNA简单说起。
DNA或脱氧核糖核酸是几乎所有具有遗传信息的生物中的复杂化学物质,可在几乎所有有机体中携带遗传信息,它位于细胞核的染色体中,人体内几乎每个细胞都具有相同的DNA。
它由四个化学碱基组成:腺嘌呤(A),鸟嘌呤(G),胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)。双螺旋DNA的结构来自腺嘌呤与胸腺嘧啶的结合和胞嘧啶与鸟嘌呤的结合。
人类DNA包含30亿个碱基,其中超过99%的碱基在所有人中都相同。碱基的顺序决定了哪些信息可用于维护生物,类似于字母构成句子的方式。DNA碱基彼此配对,还连接到糖分子和磷酸盐分子,结合形成核苷酸。这些核苷酸排列在两条长链中,形成一条称为双螺旋的螺旋。双螺旋看起来像一个梯子,碱基对形成梯级,糖和磷酸盐分子形成垂直侧板。
最近在人类活细胞内首次发现了一种新的DNA形式,名为i-motif的形式看起来像是DNA的扭曲“结”,而不是众所周知的双螺旋。i-motif,全称:intercalated-motif DNA,译为:插入基序DNA,是富含胞嘧啶的四链四链体DNA结构,类似于在富含鸟嘌呤的DNA区域中形成的G-四链体结构。
插入基序DNA复合物主要存在于细胞周期的G1期和启动子区域,可能会影响读取哪些基因序列,并可能在确定打开或关闭哪些基因方面发挥作用。正在进行实验研究来确定插入基序DNA作为生物传感器和纳米机器的纳米技术中的作用,并且甚至被认为在癌症治疗的发展中起着作用。
如图所示DNA微小分子:细胞联结起来形成循环,微型圆圈是圆形的DNA元素,科学家更容易编程和操纵。DNA分子的两端连接形成一个环,剥去了抗生素抗性标记或复制起点。它们可用于在细胞和组织中产生持续表达,可用于基因治疗。
斯坦福大学的研究表明,DNA小圆圈是健康和衰老的潜在指标,并可作为疾病的早期标记。对小圆圈的特写分析显示它们可以非常活跃。对于它们的起皱、起泡、扭结、变形和奇怪的形状,科学家说,有一天将能够控制这些形状,从而针对疾病制定针对性的治疗方法。
视图以前所未有的细节展示了当DNA挤在细胞内部时,施加于其上的应力和应变如何改变其形状。以前,科学家只能使用仅限于拍摄静态图像的显微镜才能看到DNA,而视图则揭示了原子的运动。
视图是如此详细,可以看到DNA的标志性双螺旋结构,但是当与模拟结合时,研究人员能够看到DNA中每个单个原子的位置以及它如何扭曲和扭曲。
每个人类细胞都含有两米长的DNA,为了适应我们的细胞,它已经进化为扭曲、转动和卷曲。这意味着环状DNA在基因组中无处不在,形成扭曲的结构,与放松的对应结构相比,它们显示出更多的动态行为。
研究小组研究了DNA的小圆环,这很特别,因为该分子的两端都连接在一起形成一个环。这个循环使研究人员能够给DNA小圆圈额外的扭曲,使DNA更加活跃。当研究人员对轻松的DNA成像而没有任何扭曲时,他们发现它几乎没有作用。但是,当他们给DNA加上额外的扭曲时,它突然变得更加动态,可以看出它们采用了一些非常奇特的形状。
科学家发现这些奇异的舞动是找到DNA结合伴侣的关键,因为当它们采用更广泛的形状时,那么更多种类的其他分子就会发现它具有吸引力。
能够如此详细地研究DNA,可以利用扭曲和紧缩的DNA圈如何挤入细胞的方式来加速新基因疗法的发展。
美国得克萨斯州休斯敦贝勒医学院的Lynn Zechiedrich教授说,“它们以惊人的细节显示出它们如何起皱,起泡,扭结,变性和奇怪的形状,我们希望有一天能够控制它们。”
这项工作表明,物理定律同样适用于微小的环状DNA,就像它们适用于亚原子粒子和整个星系一样。“我们可以使用超级计算机来了解扭曲DNA的物理原理。这将有助于研究人员设计定制的小圆圈以备将来使用。”